传染病防制部:
防疫科(传防办)：建立、健全疫情报告网络；准确分析疫情资料；开展传染病监测，做好疾病预测；开展预防控制试点；阐明暴发成因，掌握流行规律以及制订防治对策和控制计划。开展外来人口"三病"检疫，进行血防、疟防、丝防及其他寄生虫病防治，提出防治对策。
免疫规划科：
全面开展免疫规划接种管理工作；进行疫苗针对疾病监测与预防，严格冷链、接种门诊管理；开展免疫接种率监测、免疫效果评价、预防接种疑似异常反应处置、预防接种信息管理，为提高疫苗接种率、及时率，降低疫苗针对疾病的发病率和死亡率提出免疫预防策略。
病媒消毒科：组织开展相关传染病疫源地消毒和病媒生物控制；对各级医疗保健机构的消毒效果进行监测和指导；开展幼托机构的消毒效果监测和传染病防控指导；消毒相关生产企业生产环境和部分产品委托监测。开展蚊、蝇、鼠、蟑等病媒生物的密度消长监测和病媒生物侵害调查，指导基层病媒生物防制工作并探索新的防治措施；对病媒生物进行抗药性监测。
艾性结麻防制科：建立健全性病、艾滋病疫情报告网络；准确分析疫情资料；开展性病、艾滋病监测；做好全区性病门诊的质控；在社区开展高危人员干预工作；开展公安监管场所羁押人员HIV监测工作；每周一、二、四下午开设VCT咨询门诊；制订防治对策和控制计划。建立、健全结核病疫情报告网络；准确分析疫情资料；开展结核病化疗管理，做好肺结核病人政府减免工作；制订防治对策和控制计划。做好麻风病防治健康宣教；开展麻风病人康复慰问工作。
检验检测部:
微生物检验科：进行病原体分离及血清学诊断，为传染病防治和卫生监测、监督提供依据；负责菌、毒种的保管和管理；对医疗卫生机构与企业的微生物检验实验室进行质量控制；探索微生物检验新方法。
理化检验科：开展食品、食品包装材料的理化指标包括无机元素、有机物等的检验工作，为食源性疾病的监控及食品污染物监测预警提供技术支持；生活饮用水、化妆品、消毒产品和涉水产品的理化指标检验工作；室内健康危害因素及职业有害因素的检验工作；食物中毒、环境污染等突发性公共卫生事件的理化项目应急检验工作；严格执行国家剧毒、易燃、易爆物品管理规定，防止发生意外事故；严格执行国家计量法规规定，制定、完善质量管理体系文件和实验室管理文件，确保实验数据准确、可靠。
质量管理科：负责全中心检测工作的质量控制，计量测试仪器设备的检定和校验，标准物质的管理；开展上岗上机操作考核和发证工作；协助中心技术负责人和质量保证负责人处理质量事故和质量申诉事宜；对全中心日常检测工作实行全面质量管理。
公共卫生检测管理部:
环境卫生科：承担辖区范围内公共场所、集中空调通风系统卫生监测与评价；生活饮用水卫生监测；开展碘盐监测、碘缺乏病防治知识宣传、营养知识宣传、居民营养与膳食调查；开展食源性危害因素、食源性疾病、食源性异常病例监测和食品卫生知识宣传；环境卫生突发事件的调查与处置；承担国家空气污染与疾病监测点工作。
职业卫生科：组织实施职业人群疾病的预防、职业危害因素的控制、工作场所卫生状况的评价，同时开展职业防治相关领域研究。开展车间作业场所职业病危害因素检测与评价、放射机器与放射作业人员放射防护检测与评价、建设项目职业病危害现状评价、预评价和控制效果评价，建立和完善职业病和职业相关疾病（尤其是重点职业病）的监测预警和报告制度，研究职业有害因素（如化学、物理、生物因素）对健康造成有害的原因、机制，并对其影响程度进行评价；配合上级机构、组织下级机构实施职业危害控制计划、方案；参与全区职业病突发事件应急处置；开展职业病防治法律法规和相关知识宣传培训、日常咨询，开展企业健康促进，促进社会、企业和人力资源的可持续发展。
健康促进和慢性病防治部:
慢性病防制科：承担辖区肿瘤、心脑血管病事件和社区伤害监测，开展人群死亡和出生统计工作，组织实施社区高血压、糖尿病和肿瘤的管理和干预工作，开展慢性病高危人群筛查和管理工作，组织和指导辖区高血压、糖尿病和肿瘤等慢性病的综合防控工作。
健康教育科（健康促进办）：开展辖区内健康教育与健康促进工作指导；组织开展各类健康教育活动；编辑设计各类健康教育资料，满足全区日常性、季节性和突击性健康教育资料的需求；开展健康教育理论和方法调研，定期进行健康教育效果评价；利用协会平台，动员社会力量开展健康教育。
学校卫生科：开展学生健康发育状况的监测调查；指导和实施学生常见病的防治；开展社区卫生服务试点调研工作，对中小学生饮食营养干预及开展居民营养调查。
综合业务办公室:
负责中心的业务工作计划、总结，协助中心领导协调管理好各部和科室业务。协调中心各业务科室工作，完成业务培训、指导、质控考核、科研、继续医学教育、人才培养、论文发表等管理和信息报送工作。按照上级综合业务和疾病应急控制任务的要求，及时组织、分解、落实各项防病工作任务，组织实施各项科学有效的防控措施。接受上级的业务指导和考核。
组织人事科：负责中心组织人事日常工作，按照总支的要求做好干部职工的教育管理、单位的党建工作以及精神文明建设；做好组织宣传，负责职工政审、干部考察工作，提出选拔、转正、任免、奖惩意见；负责职工的招录、聘任、退休等管理；负责职工的工资、福利管理；根据编制做好晋升晋级管理；负责职工的人事信息、干部人事档案管理；负责离、退休职工的管理；负责纪检工作。
党政办公室：负责全中心的工作计划、总结；负责收发文件、档案管理、对外联络和会议接待等工作，同时协助中心领导做好日常管理工作。对各类发文及简报仔细校对、严格把关。负责全中心业务图书资料的订购和管理工作。负责中心信息网络管理，保障内外网和各业务系统正常运转，配合业务条线参与组织管理中心各信息化项目建设。
财务科：按时汇总、编制、上报全中心各类经费预算和年终决算；负责全中心财务管理和财务监督，指导和审核科研等各项专项经费的使用；会同有关科室开展增收节支活动。
总务科：负责全中心的药品、试剂、器材、玻璃器皿等的采购、入库保管工作；节约能源，保证水、电、煤气等设施完好通畅；车辆的调度安排和及时保养、维修；膳食供应及管理；登记、保管全中心的固定资产并组织维修；负责疾控系统冷链设备维修。负责全中心的安全保卫工作，对防火消防设备定期配置、检查和维修；对易燃、易爆、剧毒药品的保管及使用落实安全措施，并开展检查和监督。负责全中心绿化、卫生管理工作。
机构设置
